Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A5Q71RS6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms