Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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