Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FRMD7Q6ZUT3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms