Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms