Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms