Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms