Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms