Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FBXO38Q6PIJ6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO38Q6PIJ6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms