Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms