Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms