Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3HQ6NTF7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms