Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC70Q6NSX1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms