Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NANOGP8Q6NSW7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NANOGP8Q6NSW7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms