Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms