Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms