Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRAGBQ5VZM2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms