Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms