Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWK0

NBPF6, Neuroblastoma breakpoint family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF6Q5VWK0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NBPF6Q5VWK0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF6Q5VWK0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms