Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms