Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms