Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFI1BQ5VTD9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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