Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FRMPD1Q5SYB0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms