Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms