Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHC1Q5JVL4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms