Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms