Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms