Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms