Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP55Q53EZ4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms