Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK1Q52WX2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms