Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RFTN2Q52LD8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RFTN2Q52LD8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms