Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM259Q4ZIN3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms