Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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