Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP24-1Q3LI83 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP24-1Q3LI83 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms