Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF8Q3BBV2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF8Q3BBV2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms