Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PROX2Q3B8N5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROX2Q3B8N5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms