Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UVSSAQ2YD98 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms