Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF4BQ2VIQ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF4BQ2VIQ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms