Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VWC2Q2TAL6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWC2Q2TAL6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms