Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms