Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms