Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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