Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PTPRNQ16849 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PTPRNQ16849 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PTPRNQ16849 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PTPRNQ16849 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PTPRNQ16849 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PTPRNQ16849 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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PTPRNQ16849 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PTPRNQ16849 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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