Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDUFA9Q16795 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms