Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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