Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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