Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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