Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A3Q16572 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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