Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC2Q16515 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASIC2Q16515 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms