Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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