Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms